Nama asal Rahmon ialah Emomali Rakhmonov, tetapi beliau telah menukarnya kepada Emomalii Rahmon sejak 2007. Akhiran -ov pada nama keluarganya dipengaruhi oleh zaman penjajahan Rusia sejak abad ke-19 dan beliau menggugurkannya sebagai satu langkah membawa Tajikistan keluar dari pengaruh Rusia. Huruf "i" pada nama panggilan beliau berasal dari bahasa Parsi (bahasa Tajik adalah salah satu variasi standard bahasa Parsi) dan merupakan penanda rujukan bagi asal-usul seseorang ("dari Rahmon", bandingkan dengan Shirazi "dari Shiraz".)